VIH/sida y epigenética / HIV/AIDS and epigenetic

Resumen Desde 1981, el virus de la inmunodeficiencia humana ha afectado a más de 75 millones de personas en el mundo. La prevención, el diagnóstico temprano y, ante todo el empleo de la terapia antirretroviral, ha disminuido su morbimortalidad. Sin embargo, su cura y el desarrollo de una vacuna efectiva aún son objetivos no alcanzables a corto plazo. Una de las barreras para obtener su control es la persistencia crónica de los virus o sus subproductos en los denominados reservorios celulares, lo que induce un proceso inflamatorio crónico complejo que se manifiesta clínicamente como enfermedad cardiovascular, diversos tipos de cáncer, envejecimiento precoz, entre otras patologías. Los procesos intrínsecos que llevan a estos trastornos han estado siendo investigados a profundidad en los últimos años y la epigenética, definida como el estudio de las modificaciones que afectan de manera directa la expresión de los genes, pero sin cambios en la secuencia del ácido desoxirribonuncleico, puede ayudar a desentrañar estos retos. En esta revisión se analizan los mecanismos epigenéticos, como la metilación del ácido desoxirribonuncleico, las modificaciones en histonas y el ácido ribonucleico no codificante, como posibles blancos en el diagnóstico y tratamiento de la inflamación crónica y sus consecuencias clínicas asociadas al virus de inmunodeficiencia humana/sida.

Abstract Since 1981, over 75 million people have been infected with human immunodeficiency virus. The survival rate of patients with this infection has dramatically increased with the use of antiretroviral therapy, and this therapy significantly reduced the incidence of AIDS defining events. Despite recent progress, neither a cure nor a preventive vaccine against human immunodeficiency virus infection is likely to become available soon. Epigenetics is defined as the study of chemical modifications of intrinsic and extrinsic factors of the genetic code regulating gene expression. Three types of epigenetic markers have been found: DNA methylation, post-translational histone modifications, and non-coding RNA (ncRNA). In this review, we analyzed recent research about the relation between epigenetic mechanisms, the persistence of HIV in host cells, the chronic inflammatory response evoked, the cardiovascular diseases associated and premature aging in this population.

Recomendaciones para el uso de la terapia antirretroviral en infección por el virus de la inmunodeficiencia humana en Costa Rica / Guidelines for antiretroviral treatment of human immunodefiency virus infection in Costa Rica

El siguiente documento recolecta información actualizada para el abordaje de la persona con infección por el virus de inmunodeficiencia humano, adaptado a la realidad nacional. Se considera que la terapia antirretroviral debe iniciarse lo antes posible en personas con conteo linfocitario menor de 350 linfocitos T CD4+/mm3, previa valoración clínica y asegurado seguimiento estricto por parte de un equipo interdisciplinario. La carga viral será  el parámetro que se utilizará para el seguimiento y como meta, se proyecta alcanzar indetectabilidad a los 6 meses de tratamiento...

Caracterización epidemiológica, clínica y microbiológica del brote de diarrea asociado a Clostridum difficile, ocurrido en el Hospital San Juan de Dios, 2008-2009 / Epidemiologic, clinical, and microbiologic description of an outbrek of clostridium difficile associated diarrhea in Costa Rica

Antecedentes: la enfermedad diarreica asociada a Clostridium difficile (EDACD) es la causa más importante de diarrea nosocomial en el mundo. En Costa Rica, se presentó recientemente un brote de EDACD en el Hospital San Juan de Dios de San José, hospital de tercer nivel con 700 camas. En el estudio se analizan las características epidemiológicas, clínicas y microbiológicas de los pacientes con EDACD atendidos entre noviembre de 2008 y junio de 2009. Pacientes y métodos: se definió como caso de EDACD un paciente con cuadro diarreico con detección de ELISA positiva por toxina A de C. difficile en heces. Se realizó un análisis de la incidencia anual desde 2004 de EDACD, y de la incidencia mensual de EDACD en 2009 en el HSJD, así como un estudio observacional y retrospectivo de 112 expedientes médicos correspondientes a pacientes con el diagnóstico de EDACD atendidos en el hospital, en el periodo comprendido entre el 15 de noviembre de 2008 y el 15 de junio de 2009. El análisis de los datos se efectuó mediante pruebas estadísticas descriptivas y medidas de asociación...

Condición inmunológica de los pacientes portadores de VIH/Sida en el momento de su diagnóstico en el Hospital San Juan de Dios / Immune status of patientes with HIV/AIDS at the time of diagnosis in the Hospital San Juan de Dios

Objetivo: comparar el estado inmunológico al momento del diagnóstico durante 3 años, de los pacientes con VIH/Sida atendidos en el Hospital San Juan de Dios.Materiales y métodos: estudio retrospectivo, descriptivo de los casos nuevos diagnosticados con VIH/Sida, mayores de 14 años, en 2003, 2006 y 2009, en la Clínica de Atención al Paciente con VIH del Hospital San Juan de Dios, Costa Rica, según los datos en los expedientes clínicos. Para evaluar el estado inmunológico se utilizó el recuento de linfocitos T CD4+ al momento del diagnóstico del VIH, estableciéndose como diagnóstico tardío <200 células/ul. Para el análisis se realizó la estimación de las frecuencias y fuerzas de asociación entre las variables...

Síndrome demencial asociado a VIH/sida: a propósito de un paciente / HIV associated dementia, a case report

El VIH afecta el sistema nervioso produciendo variadas manifestaciones clínicas, siendo las alteraciones neuropsicológicas las más frecuentes. Se pueden encontrar cambios histopatológicos por VIH hasta en el 25 porciento de necropsias. Actualmente se considera que la demencia asociada al VIH (DA-VIH) es la causa más frecuente de demencia en personas menores de 40 años. El diagnóstico de esta entidad es importante porque se considera a la DA-VIH como enfermedad definitoria de sida, su presencia influría definitivamente en la adherencia al tratamiento y se ha observado que su evolución podría ser revertida con el uso de medicamentos antirretrovirales. El estudio y seguimiento de estos pacientes deberá basarse en las manifestaciones clínicas, análisis neuropsicológicos y el uso de neuroimágenes. Se presenta el caso de un paciente masculino de 39 años que inició con pérdida progresiva de la memoria y temblor fino distal al que se le diagnosticó síndrome demencial asociado a VIH estudiado por medios clínicos, neuropsicológico y por neuroimágenes. Se hace énfasis en la fisiopatología de este transtorno, la importancia de su diagnóstico adecuado así como del uso del tratamiento antirretroviral.

Enfermedad de Lyme, Borreliosis de Lyme, en Costa Rica / Lyme disease in Costa Rica, a case report

La enfermedad de Lyme o borreliosis de Lyme es una zoonosis transmitida por garrapatas del género Ixodes y producida por la espiroqueta borrelia burgdorferi. Ha sido descrita principalmente en Norteamérica, Europa y Asia, y se caracteriza clínicamente por una presentación en tres etapas: inicial con eritema migrans que comienza alrededor de la picadura de la garrapata; infección diseminada con fiebre, ataque al estado general, artritis migratoria, linfadenopatías, alteraciones neurológicas y hepatitis; y la forma crónica, caracterizada por artritis, periostitis, encefalomielitis crónica y polirradiculopatía, entre otras manifestaciones. En Costa Rica se desconocen notificaciones de pacientes con esta patología, por lo que se presenta el caso de una mujer adulta que tras un viaje al Estado de La Florida en los Estados Unidos, presentó cuadro clínico y serológico compatible con la forma leve de la enfermedad de Lyme. Se discuten los hallazgos y se alerta sobre la posibilidad de diagnosticar esta zoonosis, dado el auge del turismo ecológico en estos días.

Variability in HIV-1 partial genomic sequences in Costa Rican patients: analysis with different bioinformatics tools.

OBJECTIVE: To estimate subtype and genomic variability in the HIV pol gene of Costa Rican patients by using different bioinformatics tools and to use this information to establish new policies to better manage these patients. METHODS: A total of 113 pol sequences available from Costa Rican patients under highly active antiretroviral therapy were analyzed by using the Genotyping, REGA, Stanford, and MEGA programs. The pol sequences came from 77 virologic failures (VF) and 36 basal samples (BS). Of the 77 VF, 22 also were sequenced in the env region. RESULTS: No major differences were found among the variables studied. However, there was a tendency for more variability in VF patients with a high baseline viral load. In the pol gene, 75%-83% of BS and 66%-75% of VF samples were pure B subtype by Genotyping and REGA, respectively. The other samples presented variations related mainly to circulating recombinant form CRF12 by genotyping or to CRF17 or -29 by phylogenetic analysis or a new possible BD recombinant with all programs. In the Stanford program, all variable samples showed a subtype B with high polymorphism. The variability in the env sequences was lower than that in the pol region. CONCLUSION: The B subtype is predominant in Costa Rican HIV-positive patients. There is high variability within sequences with potential recombination between B and F or D subtypes. The BD recombinant has not been previously reported. This high variability is likely the result of possible recombinant events, nonadherence to antiretroviral therapy, sexual intercourse without protection, and many sexual partners. Similar studies should be done in other countries in the Region, in particular in those places with extensive immigration, in order to decrease the possibility of virus variability as well as the cost of antiretroviral therapy.

Variability in HIV-1 partial genomic sequences in Costa Rican patients: analysis with different bioinformatics tools / Variabilidad de secuencias genómicas parciales del VIH-1 en pacientes costarricenses: análisis con diferentes herramientas bioinformáticas

OBJECTIVE: To estimate subtype and genomic variability in the HIV pol gene of Costa Rican patients by using different bioinformatics tools and to use this information to establish new policies to better manage these patients. METHODS: A total of 113 pol sequences available from Costa Rican patients under highly active antiretroviral therapy were analyzed by using the Genotyping, REGA, Stanford, and MEGA programs. The pol sequences came from 77 virologic failures (VF) and 36 basal samples (BS). Of the 77 VF, 22 also were sequenced in the env region. RESULTS: No major differences were found among the variables studied. However, there was a tendency for more variability in VF patients with a high baseline viral load. In the pol gene, 75 percent-83 percent of BS and 66 percent-75 percent of VF samples were pure B subtype by Genotyping and REGA, respectively. The other samples presented variations related mainly to circulating recombinant form CRF12 by genotyping or to CRF17 or -29 by phylogenetic analysis or a new possible BD recombinant with all programs. In the Stanford program, all variable samples showed a subtype B with high polymorphism. The variability in the env sequences was lower than that in the pol region. CONCLUSION: The B subtype is predominant in Costa Rican HIV-positive patients. There is high variability within sequences with potential recombination between B and F or D subtypes. The BD recombinant has not been previously reported. This high variability is likely the result of possible recombinant events, nonadherence to antiretroviral therapy, sexual intercourse without protection, and many sexual partners. Similar studies should be done in other countries in the Region, in particular in those places with extensive immigration, in order to decrease the possibility of virus variability as well as the cost of antiretroviral therapy.

OBJETIVOS: Determinar el subtipo y la variabilidad genómica del gen pol del VIH de pacientes costarricenses mediante diferentes herramientas bioinformáticas y el uso de esta información para establecer nuevas políticas para mejorar el diagnóstico y el tratamiento de estos pacientes. MÉTODOS: Se analizaron 113 secuencias del gen pol de pacientes costarricenses bajo tratamiento antirretrovírico de gran actividad mediante cuatro programas: Genotyping, REGA, Stanford y MEGA. Las secuencias pol analizadas provenían de 77 casos considerados fracasos virológicos (FV) y 36 muestras iniciales (MI). También se secuenció la región env de 22 de los 77 FV. RESULTADOS: No se encontraron diferencias importantes entre las variables estudiadas. No obstante, se observó una tendencia a una mayor variabilidad en los pacientes FV que tenían una elevada carga viral inicial. Con respecto al gen pol, 77-83 por ciento de las MI y 66-75 por ciento de las muestras de los FV eran del subtipo B puro según Genotyping y REGA, respectivamente. Las otras muestras presentaron variaciones relacionadas principalmente con la forma recombinante en circulación CRF-12 según Genotyping, con la CRF-17 o la CRF-29 según el análisis filogenético, o una nueva posible forma recombinante BD según todos los programas. Con el programa Stanford, todas las muestras variables reflejaron un subtipo B con elevado polimorfismo. La variabilidad de la secuencia env fue menor que la de la región pol. CONCLUSIONES: El subtipo B fue el predominante en los pacientes positivos al VIH en Costa Rica. Existe una alta variabilidad en las secuencias con una posible recombinación entre los subtipos B, y F o D. La forma recombinante BD no se había notificado antes. Esta elevada variabilidad parece ser el resultado de posibles eventos de recombinación, la falta de adhesión al tratamiento antirretrovírico, las relaciones sexuales sin protección y numerosas parejas sexuales. Se deben emprender estudios similares en otros países de la Región, en particular en los lugares con mucha inmigración, para reducir tanto la posibilidad de que el virus varíe como el costo del tratamiento antirretrovírico.

Neutropenia crónica e infección por el virus de la inmunodeficiencia humana / Chronic neutropenia and human immunodeficiency virus infection

Se presenta el caso de un paciente masculino con neutropenia crónica e infección por el virus de immunodeficiencia humana, con una revisión de los posibles mecanismos patogénicos. Las alteraciones hematológicas como anemia, trombocitopenia y leucopenia se presentan asociadas con frecuencia a la infección aguda por el virus de inmunodeficiencia humana. Al establecer la terapia antirretroviral y disminuir la actividad del virus, estas alteraciones tienden a mejorar. Sin embargo, algunos fármacos antirretrovirales, como la zidovudina, poseen toxicidad medular y pueden producir o empeorar las alteraciones hematológicas en estos pacientes, lo cual lleva a cambios en los esquemas de tratamiento. Los citotóxicos y antimetabolitos empleados en el tratamiento de neoplasias asociadas tienen conocida actividad depresora sobre la médula ósea. Algunos antimicrobianos utilizados en la profilaxis de infecciones poseen también toxicidad hematológica conocida, como el trimetoprim-sulfametaxazol, por lo que deben ser utilizados con precaución en pacientes con infección por el virus de inmunodeficiencia humana. Por otro lado, se plantean mecanismos alternativos que causan neutropenia en estos pacientes, como la formación de anticuerpos antineutrófilos, daño primario del progenitor granulocítico, por desbalance en la producción de neutrófilos, por anticuerpos contra la glicoproteína gp 120 de la cápside viral del VIH, y deficiencias vitamínicas. En el caso del paciente neutropénico febril, en quien se sospecha infección bacteriana grave, se pueden utilizar los factores estimulantes de las colonias de granulocitos para aumentar los conteos absolutos de neutrófilos y mejorar la recuperación clínica.

Infecciones nosocomiales por bacterias productoras de B-lactamasa de espectro ampliado: prevalencia, factores de riesgo y análisis molecular / Nosocomiales infections by producing bacteria of B lactamasa of extended phantom: prevalence, factors of risk and molecular analysis

Justificación y objetivos: La producción de B-lactamasas es uno de los principales mecanismos de resistencia a antibióticos utilizados por las bacterias Gram negativas. A partir de los años 80 se describe en Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae un nuevo tipo de estas enzimas, las B-lactamasas de espectro ampliado (BLEA) que inactivan todos los antibióticos B-lactámicos, con excepción de los carbapenémicos. Su diseminación global ha sido muy rápida, lo que ha creado problemas terapéuticos importantes. Este trabajo tiene como objetivos el análisis de la frecuencia de las infecciones producidas por estas bacterias en pacientes internados en el Hospital San Juan de Dios (HSJD), los factores de riesgo para su adquisición y el análisis molecular de las enzimas identificadas...

Prevalencia e identificación genotípica de Enterococos Vancomicina resistente en pacientes en un medio hospitalario / Genotype prevalence e identification of Vancomycin-Resistant Enterococcus in patients in hospitable means

Justificación y Objetivos: Los enterococos son cocos Gram positivos y las especies de importancia médica son Enterococcus faecalis y E. faecium como productores de la mayoría de infecciones en el ser humano y E.casseliflavus, E.gallinarum, E. durans, E.hirae, E.raffinosus, y E.avium raramente aislados de muestras clínicas pero que pueden poseer genes extracromosómicos que los hacen intrínsicamente resistentes a los glucopéptidos, los que podrían ser transferidos a E.faecalis y E. faecium. La colonización por estas bacterias es frecuente en pacientes gravemente enfermos ingresados en unidaddes de cuidado intensivo (UCI) y es un factor predisponente para septicemia. Los objetivos de este trabajo son la identificación de pacientes colonizados por enterococos vancomicina resistentes (EVR) en medios hospitalarios nacionales, el análisis de la sensibilidad a antibióticos de las bacterias aisladas, el estudio de los factores de riesgo para adquirirlas y de los aislamientos con alta resistencia a la vancomicina, con el fin de identificar determinantes genéticos de resistencia. Pacientes y métodos: Estudio prospectivo, que se desarrolló de mayo a agosto del año 2001. Se incluyeron 106 pacientes internados en las unidades de cuidado intensivo del Hospital México, Hospital San Juan de Dios y Servicio de emergencias médicas de este último nosocomio, a los que se les tomaron hisopados rectales, los que fueron cultivados para identificar la presencia de EVR. Se determinaron las concentraciones mínimas inhibidoras (CIM) para vancomicina, y se realizó el estudio genético de las cepas con CIMs más altas. Resultados: La tasa de colonización del tracto gastrointestinal de los pacientes fue de 52 por ciento. Empleando las pruebas de chi cuadrado y de regresión logística, se identificaron factores que intervienen en la colonización por estas bacterias, siendo el servicio de procedencia antes del ingreso a las respectivas UCI, los días de estancia en UCI y el uso previo de cefalosporinas de tercera generación los principales. El 29.6 por cieto de los aislamientos de enterococos resistentes a vancomicina tenían >-512 ug/ml, todos poseían el gen van A y correspondieron a E. gallinarum, E.faecium, E.casselilflavus y E.hirae. Todos los aislamientos de Enterococcus faecalis mostraron CIM £ 16ug/ml a la vancomicina...

Resistencia bacteriana a antibióticos en el Hospital San Juan de Dios, 1995-1999 / Bacterial resistance at antibiotics in the Hospital San Juan de Dios 1995-1999

Justificación: La resistencia a antibióticos por parte de bacterias patógenas es un grave problema mundial. Su control ha sido difícil pero deben hacerse todos los esfuerzos por realizarlo. Conocer la epidemiología en las diferentes regiones y países se constituye en parte importante de este control. Este estudio se llevó a cabo con el fin de analizar el comportamiento de la resistencia en el hospital San Juan de Dios, centro de atención nacional de adultos de aproximadamente 700 camas. Materiales y métodos: El estudio se basó en los datos obtenidos en los años 1995-1999 ya que en 1995 se inició el empleo de equipo automatizado VITEK en este hospital. Se analizaron 2817 aislamientos de cocos Gram positivos (CGP) y 7627 de bacilos Gram negativos (BGN) obtenidos de todos los sitios anatómicos y fluidos corporales. Por ser un estudio retrospectivo, no se pudo definir cuáles aislamientos provenían de infecciones intra o extrahospitalarias. Resultados: Staphylococcus aureus fue el CGP más frecuente aislado, mientras que el BGN más frecuente fue Eschericha coli. En más de 90 por ciento de los estafilococos aislados se demostró resistencia a la penicilina. La resistencia a la oxacilina en S.aureus se incrementó de 35 por ciento en 1995 a 52 por ciento en 1999 mienttras que en los estafilococos coagulasa negativa, pasó de 70 a 77 por ciento en el mismo periodo. La resistencia a la clindamicina en ambos grupos bacterianos se mantuvo relativamente estable. No se demostró resistencia a la vancomicina. La mayoría de los enterococos aislados correspondieron a E.faecalis, 75 por ciento de ellos fueron sensibles a la penicilina y 50 por ciento no demostaron sinergismo de la gentamicina con los antibióticos que actúan sobre la pared. No se encontraron enterococos vancomicina resistentes. En las enterobacterias se observó un aumento importante de la resistencia a cefalosporinas de tercera generación. E.coli mostró un aumento de la resistencia a ceftazidima de 10 por ciento...

Linfadenitis por Cryptococcus Neoforms en un paciente con enfermedad por VIH / Lymphadenitis for Cryptococcus Neoforms in a patint with disease for VIH

La criptococosis es una de las micosis más frecuentes en pacientes con enfermedad por VIH. La forma más severa es la meníngea, sin embargo puede localizarse en diversos órganos. La linfadenopatías son un hallazgo frecuente en los pacientes con infección/enfermedad por VIH y su etiología es compleja. Se presenta el caso de un paciente con enfermedad por VIH y linfadenopatías cervicales por Cryptococcus neoformans, presentación poco frecuente de esta entidad. Se enfatiza sobre la necesidad de realizar estudios exhaustivos con el fin de esclarecer la etiología de las linfadenopatías en estos pacientes.

Leptospirosis en humanos / Human Leptospirosis

La leptospirosis humana es una zoonosis con amplia distribución mundial. Es una enfermedad febril aguda, causada por bacterias del género Leptospira, que infectan a variados animales domésticos y silvestres, los que frecuentemente se transforman en portadores asintomáticos. El hombre se puede infectar en contacto con agua contaminada con la orina de estos animales. En Costa Rica, desde hace varios años el interés sobre el estudio de esta zoonosis ha venido en aumento, con la identificación de epidemias y de múltiples casos aislados, por lo que su conocimiento es de gran importancia. El propósito de este trabajo es revisar la literatura escrita en lengua inglesa sobre leptospirosis, y hacen énfasis en su fisiopatología, el diagnóstico de laboratorio y su tratamiento....

Tuberculosis multirresistente a propósito de dos pacientes / Multi-resistant tuberculosis: two patients

El número de pacientes con tuberculosis ha aumentado en forma importante en los últimos años en todo el mundo por múltiples razones, entre las que el empobrecimiento generalizado de las poblaciones de los países pobres, las migraciones de pobladores de estos países a zonas con mejores condiciones de vida, la pandemia del SIDA, el deterioro de las condiciones sanitarias en muchas regiones así como la disminución de los presupuestos para la salud, explicarían este fenómeno. Asociado a esto, se ha observado el incremento alarmante de los casos de tuberculosis multirresistente, con la importancia que este problema tiene sobre la salud pública. Por las características epidemiológicas, bacteriológicas, clínicas y terapéuticas de la tuberculosis multirresistente, su conocimiento reviste trascendental importancia, por lo que se analizan dos pacientes con tuberculosis multirresistentes atendidos en nuestros hospitales, llamando la atención sobre las implicaciones que tiene sobre la salud pública de Costa Rica